Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms