Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms