Protein–RNA interactions for Protein: P51685

CCR8, C-C chemokine receptor type 8, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR8P51685 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCR8P51685 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCR8P51685 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCR8P51685 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCR8P51685 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCR8P51685 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCR8P51685 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCR8P51685 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCR8P51685 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCR8P51685 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCR8P51685 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCR8P51685 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCR8P51685 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCR8P51685 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCR8P51685 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCR8P51685 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCR8P51685 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCR8P51685 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCR8P51685 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCR8P51685 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCR8P51685 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCR8P51685 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCR8P51685 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCR8P51685 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCR8P51685 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCR8P51685 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCR8P51685 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CCR8P51685 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCR8P51685 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCR8P51685 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCR8P51685 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCR8P51685 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCR8P51685 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCR8P51685 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCR8P51685 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCR8P51685 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCR8P51685 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCR8P51685 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCR8P51685 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCR8P51685 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCR8P51685 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCR8P51685 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCR8P51685 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCR8P51685 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCR8P51685 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCR8P51685 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCR8P51685 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCR8P51685 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCR8P51685 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCR8P51685 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCR8P51685 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CCR8P51685 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCR8P51685 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCR8P51685 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCR8P51685 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCR8P51685 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCR8P51685 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCR8P51685 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCR8P51685 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCR8P51685 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCR8P51685 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCR8P51685 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCR8P51685 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCR8P51685 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCR8P51685 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCR8P51685 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCR8P51685 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCR8P51685 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCR8P51685 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCR8P51685 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCR8P51685 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCR8P51685 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCR8P51685 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCR8P51685 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCR8P51685 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCR8P51685 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCR8P51685 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCR8P51685 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCR8P51685 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCR8P51685 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCR8P51685 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCR8P51685 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCR8P51685 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCR8P51685 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCR8P51685 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCR8P51685 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCR8P51685 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCR8P51685 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCR8P51685 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCR8P51685 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCR8P51685 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCR8P51685 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCR8P51685 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCR8P51685 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCR8P51685 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCR8P51685 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCR8P51685 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCR8P51685 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCR8P51685 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCR8P51685 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms