Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLMP48507 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLMP48507 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLMP48507 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLMP48507 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLMP48507 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLMP48507 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLMP48507 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLMP48507 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLMP48507 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLMP48507 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLMP48507 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLMP48507 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLMP48507 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLMP48507 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLMP48507 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLMP48507 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLMP48507 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLMP48507 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLMP48507 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLMP48507 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLMP48507 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLMP48507 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLMP48507 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLMP48507 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLMP48507 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLMP48507 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLMP48507 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLMP48507 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLMP48507 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLMP48507 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLMP48507 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLMP48507 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLMP48507 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLMP48507 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLMP48507 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLMP48507 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLMP48507 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLMP48507 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLMP48507 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLMP48507 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLMP48507 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLMP48507 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLMP48507 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLMP48507 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLMP48507 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLMP48507 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLMP48507 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLMP48507 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLMP48507 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLMP48507 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLMP48507 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLMP48507 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLMP48507 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLMP48507 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLMP48507 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLMP48507 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLMP48507 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLMP48507 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLMP48507 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLMP48507 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLMP48507 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLMP48507 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLMP48507 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLMP48507 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLMP48507 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLMP48507 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLMP48507 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLMP48507 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLMP48507 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLMP48507 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLMP48507 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLMP48507 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLMP48507 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLMP48507 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLMP48507 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLMP48507 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLMP48507 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLMP48507 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLMP48507 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLMP48507 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLMP48507 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLMP48507 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLMP48507 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLMP48507 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLMP48507 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLMP48507 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLMP48507 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLMP48507 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLMP48507 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLMP48507 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLMP48507 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLMP48507 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLMP48507 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLMP48507 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLMP48507 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLMP48507 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLMP48507 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCLMP48507 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCLMP48507 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms