Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms