Protein–RNA interactions for Protein: P34995

PTGER1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER1P34995 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTGER1P34995 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms