Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFNP31947 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFNP31947 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFNP31947 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFNP31947 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFNP31947 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFNP31947 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFNP31947 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFNP31947 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFNP31947 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFNP31947 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFNP31947 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFNP31947 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFNP31947 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFNP31947 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFNP31947 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFNP31947 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFNP31947 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFNP31947 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFNP31947 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFNP31947 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFNP31947 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFNP31947 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFNP31947 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFNP31947 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFNP31947 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFNP31947 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFNP31947 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFNP31947 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFNP31947 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SFNP31947 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFNP31947 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFNP31947 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SFNP31947 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFNP31947 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFNP31947 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFNP31947 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFNP31947 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFNP31947 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFNP31947 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFNP31947 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFNP31947 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFNP31947 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFNP31947 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFNP31947 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFNP31947 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFNP31947 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFNP31947 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFNP31947 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFNP31947 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFNP31947 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFNP31947 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFNP31947 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SFNP31947 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFNP31947 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SFNP31947 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFNP31947 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFNP31947 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFNP31947 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFNP31947 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFNP31947 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFNP31947 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFNP31947 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFNP31947 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFNP31947 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFNP31947 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFNP31947 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFNP31947 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFNP31947 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFNP31947 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SFNP31947 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SFNP31947 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFNP31947 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFNP31947 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFNP31947 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFNP31947 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFNP31947 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFNP31947 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFNP31947 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFNP31947 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFNP31947 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFNP31947 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFNP31947 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SFNP31947 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFNP31947 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFNP31947 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFNP31947 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SFNP31947 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFNP31947 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFNP31947 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFNP31947 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFNP31947 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFNP31947 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SFNP31947 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFNP31947 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFNP31947 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFNP31947 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFNP31947 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFNP31947 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFNP31947 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms