Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms