Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms