Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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