Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL3P19876 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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