Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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NFKB1P19838 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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NFKB1P19838 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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NFKB1P19838 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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NFKB1P19838 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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NFKB1P19838 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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NFKB1P19838 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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NFKB1P19838 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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NFKB1P19838 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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