Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DESP17661 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DESP17661 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DESP17661 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DESP17661 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DESP17661 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DESP17661 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DESP17661 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DESP17661 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DESP17661 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DESP17661 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DESP17661 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DESP17661 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DESP17661 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DESP17661 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DESP17661 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DESP17661 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DESP17661 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DESP17661 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DESP17661 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DESP17661 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DESP17661 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DESP17661 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DESP17661 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DESP17661 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DESP17661 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DESP17661 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DESP17661 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DESP17661 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DESP17661 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DESP17661 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DESP17661 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DESP17661 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DESP17661 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DESP17661 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DESP17661 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DESP17661 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DESP17661 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DESP17661 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DESP17661 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DESP17661 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DESP17661 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DESP17661 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DESP17661 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DESP17661 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DESP17661 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DESP17661 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DESP17661 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DESP17661 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DESP17661 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DESP17661 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DESP17661 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DESP17661 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DESP17661 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DESP17661 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DESP17661 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DESP17661 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DESP17661 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DESP17661 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DESP17661 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DESP17661 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DESP17661 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DESP17661 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DESP17661 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DESP17661 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DESP17661 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DESP17661 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DESP17661 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DESP17661 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DESP17661 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DESP17661 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DESP17661 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DESP17661 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DESP17661 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DESP17661 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DESP17661 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DESP17661 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DESP17661 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DESP17661 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DESP17661 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DESP17661 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DESP17661 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DESP17661 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DESP17661 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DESP17661 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DESP17661 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DESP17661 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DESP17661 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DESP17661 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DESP17661 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DESP17661 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DESP17661 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DESP17661 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DESP17661 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DESP17661 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DESP17661 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DESP17661 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DESP17661 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DESP17661 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DESP17661 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms