Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSP16219 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSP16219 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSP16219 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSP16219 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSP16219 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSP16219 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSP16219 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSP16219 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSP16219 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSP16219 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSP16219 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSP16219 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSP16219 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSP16219 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSP16219 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSP16219 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSP16219 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSP16219 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSP16219 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSP16219 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSP16219 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSP16219 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSP16219 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSP16219 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSP16219 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSP16219 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSP16219 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSP16219 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSP16219 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSP16219 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSP16219 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSP16219 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSP16219 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSP16219 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSP16219 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSP16219 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSP16219 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSP16219 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSP16219 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSP16219 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSP16219 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSP16219 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSP16219 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSP16219 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSP16219 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSP16219 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSP16219 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSP16219 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSP16219 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSP16219 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSP16219 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSP16219 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSP16219 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSP16219 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSP16219 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSP16219 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSP16219 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSP16219 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSP16219 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSP16219 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSP16219 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSP16219 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSP16219 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACADSP16219 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSP16219 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSP16219 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSP16219 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSP16219 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSP16219 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSP16219 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSP16219 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSP16219 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSP16219 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSP16219 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSP16219 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSP16219 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSP16219 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSP16219 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSP16219 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSP16219 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSP16219 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSP16219 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSP16219 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSP16219 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSP16219 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSP16219 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSP16219 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSP16219 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSP16219 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSP16219 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSP16219 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSP16219 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSP16219 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSP16219 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSP16219 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSP16219 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSP16219 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSP16219 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSP16219 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms