Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW3

SMIM10L1, Small integral membrane protein 10-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L1P0DMW3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM10L1P0DMW3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms