Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00032P0C843 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms