Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPBP07199 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPBP07199 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPBP07199 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPBP07199 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPBP07199 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPBP07199 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPBP07199 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPBP07199 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPBP07199 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPBP07199 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPBP07199 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPBP07199 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPBP07199 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPBP07199 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPBP07199 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPBP07199 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPBP07199 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPBP07199 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPBP07199 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPBP07199 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPBP07199 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPBP07199 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPBP07199 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPBP07199 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPBP07199 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPBP07199 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPBP07199 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPBP07199 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPBP07199 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPBP07199 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPBP07199 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPBP07199 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPBP07199 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPBP07199 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPBP07199 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPBP07199 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPBP07199 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPBP07199 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPBP07199 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPBP07199 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPBP07199 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPBP07199 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPBP07199 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPBP07199 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPBP07199 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPBP07199 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPBP07199 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPBP07199 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPBP07199 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPBP07199 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPBP07199 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPBP07199 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPBP07199 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPBP07199 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPBP07199 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPBP07199 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPBP07199 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPBP07199 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPBP07199 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPBP07199 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPBP07199 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPBP07199 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPBP07199 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPBP07199 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPBP07199 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPBP07199 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPBP07199 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPBP07199 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPBP07199 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPBP07199 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPBP07199 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPBP07199 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPBP07199 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPBP07199 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPBP07199 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPBP07199 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPBP07199 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPBP07199 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPBP07199 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPBP07199 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPBP07199 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPBP07199 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPBP07199 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPBP07199 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPBP07199 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPBP07199 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPBP07199 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPBP07199 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPBP07199 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPBP07199 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPBP07199 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPBP07199 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPBP07199 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPBP07199 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPBP07199 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPBP07199 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPBP07199 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPBP07199 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPBP07199 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms