Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF2P04141 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF2P04141 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF2P04141 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF2P04141 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF2P04141 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF2P04141 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF2P04141 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF2P04141 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF2P04141 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF2P04141 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF2P04141 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF2P04141 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF2P04141 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF2P04141 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF2P04141 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF2P04141 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF2P04141 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF2P04141 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF2P04141 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF2P04141 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF2P04141 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF2P04141 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF2P04141 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF2P04141 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF2P04141 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF2P04141 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF2P04141 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF2P04141 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF2P04141 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF2P04141 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF2P04141 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF2P04141 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF2P04141 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF2P04141 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF2P04141 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF2P04141 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF2P04141 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF2P04141 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF2P04141 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF2P04141 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF2P04141 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF2P04141 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF2P04141 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF2P04141 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSF2P04141 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSF2P04141 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSF2P04141 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSF2P04141 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSF2P04141 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSF2P04141 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms