Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIOO75962 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIOO75962 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIOO75962 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIOO75962 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIOO75962 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIOO75962 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIOO75962 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIOO75962 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIOO75962 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIOO75962 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIOO75962 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIOO75962 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIOO75962 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIOO75962 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIOO75962 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIOO75962 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIOO75962 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIOO75962 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIOO75962 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIOO75962 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIOO75962 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIOO75962 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIOO75962 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIOO75962 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIOO75962 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIOO75962 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIOO75962 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIOO75962 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIOO75962 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIOO75962 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIOO75962 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIOO75962 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIOO75962 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIOO75962 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIOO75962 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIOO75962 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIOO75962 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIOO75962 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIOO75962 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIOO75962 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIOO75962 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIOO75962 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIOO75962 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIOO75962 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIOO75962 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIOO75962 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIOO75962 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIOO75962 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIOO75962 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIOO75962 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIOO75962 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIOO75962 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIOO75962 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIOO75962 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIOO75962 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIOO75962 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIOO75962 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIOO75962 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIOO75962 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIOO75962 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIOO75962 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIOO75962 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIOO75962 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIOO75962 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIOO75962 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIOO75962 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIOO75962 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIOO75962 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIOO75962 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIOO75962 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIOO75962 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIOO75962 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIOO75962 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIOO75962 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIOO75962 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIOO75962 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIOO75962 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIOO75962 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIOO75962 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIOO75962 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIOO75962 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIOO75962 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIOO75962 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIOO75962 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIOO75962 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIOO75962 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIOO75962 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIOO75962 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIOO75962 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIOO75962 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIOO75962 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIOO75962 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIOO75962 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIOO75962 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIOO75962 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIOO75962 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIOO75962 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIOO75962 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIOO75962 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms