Protein–RNA interactions for Protein: O75665

OFD1, Oral-facial-digital syndrome 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OFD1O75665 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OFD1O75665 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OFD1O75665 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OFD1O75665 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OFD1O75665 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OFD1O75665 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OFD1O75665 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OFD1O75665 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OFD1O75665 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OFD1O75665 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OFD1O75665 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OFD1O75665 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OFD1O75665 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OFD1O75665 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OFD1O75665 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OFD1O75665 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OFD1O75665 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OFD1O75665 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OFD1O75665 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OFD1O75665 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OFD1O75665 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OFD1O75665 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OFD1O75665 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OFD1O75665 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OFD1O75665 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OFD1O75665 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OFD1O75665 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OFD1O75665 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OFD1O75665 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OFD1O75665 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OFD1O75665 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OFD1O75665 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OFD1O75665 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
OFD1O75665 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OFD1O75665 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OFD1O75665 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OFD1O75665 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OFD1O75665 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OFD1O75665 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OFD1O75665 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OFD1O75665 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
OFD1O75665 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
OFD1O75665 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OFD1O75665 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OFD1O75665 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OFD1O75665 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OFD1O75665 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OFD1O75665 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OFD1O75665 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OFD1O75665 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OFD1O75665 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OFD1O75665 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OFD1O75665 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OFD1O75665 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OFD1O75665 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OFD1O75665 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OFD1O75665 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OFD1O75665 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OFD1O75665 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OFD1O75665 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OFD1O75665 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OFD1O75665 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OFD1O75665 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OFD1O75665 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OFD1O75665 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OFD1O75665 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OFD1O75665 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OFD1O75665 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OFD1O75665 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OFD1O75665 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OFD1O75665 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OFD1O75665 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OFD1O75665 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OFD1O75665 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
OFD1O75665 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OFD1O75665 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OFD1O75665 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OFD1O75665 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OFD1O75665 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OFD1O75665 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
OFD1O75665 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OFD1O75665 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OFD1O75665 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
OFD1O75665 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OFD1O75665 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OFD1O75665 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OFD1O75665 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OFD1O75665 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OFD1O75665 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OFD1O75665 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OFD1O75665 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OFD1O75665 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OFD1O75665 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OFD1O75665 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OFD1O75665 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OFD1O75665 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OFD1O75665 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OFD1O75665 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OFD1O75665 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OFD1O75665 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms