Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms