Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms