Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms