Protein–RNA interactions for Protein: O60664

PLIN3, Perilipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN3O60664 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLIN3O60664 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms