Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F3O00716 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F3O00716 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F3O00716 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F3O00716 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F3O00716 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F3O00716 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F3O00716 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F3O00716 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F3O00716 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F3O00716 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F3O00716 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F3O00716 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F3O00716 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F3O00716 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F3O00716 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F3O00716 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F3O00716 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F3O00716 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F3O00716 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F3O00716 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F3O00716 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F3O00716 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F3O00716 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F3O00716 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F3O00716 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F3O00716 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F3O00716 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F3O00716 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F3O00716 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F3O00716 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F3O00716 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F3O00716 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F3O00716 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F3O00716 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F3O00716 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F3O00716 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F3O00716 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F3O00716 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F3O00716 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F3O00716 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F3O00716 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F3O00716 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F3O00716 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F3O00716 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F3O00716 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F3O00716 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F3O00716 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F3O00716 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F3O00716 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F3O00716 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F3O00716 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F3O00716 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F3O00716 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F3O00716 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F3O00716 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F3O00716 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F3O00716 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F3O00716 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F3O00716 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F3O00716 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F3O00716 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F3O00716 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F3O00716 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F3O00716 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F3O00716 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F3O00716 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F3O00716 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F3O00716 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F3O00716 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F3O00716 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F3O00716 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F3O00716 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F3O00716 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F3O00716 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F3O00716 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F3O00716 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F3O00716 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F3O00716 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F3O00716 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F3O00716 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F3O00716 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F3O00716 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F3O00716 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F3O00716 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F3O00716 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F3O00716 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F3O00716 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F3O00716 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F3O00716 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F3O00716 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F3O00716 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F3O00716 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F3O00716 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F3O00716 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F3O00716 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F3O00716 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F3O00716 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F3O00716 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F3O00716 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms