Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1E9PL57 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1E9PL57 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms