Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms