Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 SDHD-204ENST00000528021 1071 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 AP001830.1-201ENST00000528717 692 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 AC008567.2-201ENST00000589751 656 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 AC018695.4-201ENST00000602706 689 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTLL13PA6NNM8 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms