Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms