Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC144AA2RUR9 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms