Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNX13Q9Y5W8 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX13Q9Y5W8 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX13Q9Y5W8 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNX13Q9Y5W8 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX13Q9Y5W8 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX13Q9Y5W8 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNX13Q9Y5W8 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX13Q9Y5W8 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX13Q9Y5W8 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX13Q9Y5W8 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX13Q9Y5W8 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX13Q9Y5W8 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX13Q9Y5W8 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX13Q9Y5W8 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX13Q9Y5W8 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX13Q9Y5W8 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX13Q9Y5W8 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX13Q9Y5W8 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX13Q9Y5W8 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX13Q9Y5W8 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX13Q9Y5W8 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX13Q9Y5W8 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX13Q9Y5W8 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX13Q9Y5W8 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX13Q9Y5W8 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX13Q9Y5W8 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX13Q9Y5W8 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX13Q9Y5W8 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX13Q9Y5W8 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SNX13Q9Y5W8 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX13Q9Y5W8 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX13Q9Y5W8 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX13Q9Y5W8 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX13Q9Y5W8 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX13Q9Y5W8 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SNX13Q9Y5W8 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX13Q9Y5W8 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX13Q9Y5W8 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX13Q9Y5W8 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms