Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVW-1Q9UQF0 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms