Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV0

CEP164, Centrosomal protein of 164 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP164Q9UPV0 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CEP164Q9UPV0 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms