Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms