Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms