Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 DNAJB5-204ENST00000454002 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms