Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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VAPAQ9P0L0 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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VAPAQ9P0L0 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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VAPAQ9P0L0 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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VAPAQ9P0L0 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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VAPAQ9P0L0 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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