Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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