Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms