Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms