Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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