Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms