Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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SMIM3Q9BZL3 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
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SMIM3Q9BZL3 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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SMIM3Q9BZL3 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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