Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms