Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms