Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBB6Q9BUF5 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms