Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms