Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3GL2Q99962 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.9 ms