Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms