Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms